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DNA break repair outcome predictions

Guide: TTCTTCATAGAAATCCGATT CGG

The following table lists possible deletions and insertions, scored by the Lindel repair model.
Each sequence below represents the context around the guide's target, with deleted nucleotides shown as "-".
Sequences are ranked by their probability, as predicted by the method of Chen et al. 2019.

Probability Sequence Effect
AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG | ATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT wild-type
29.63% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAAT--- | --TCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D5 -3
9.68% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG | -----GTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D5 0
6.23% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG X ATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT I3+X
3.27% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATC-- | ----GGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D6 -2
2.99% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATC-- | ATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D2 -2
2.70% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG | -TTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D1 0
2.45% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG | --TCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D2 0
2.24% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG G ATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT I1+G
1.91% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAA----- | -TTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D6 -5
1.80% AGCTCACCTCGATTTCTTCAT--------- | --TCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D11 -9
1.68% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG | ------TGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D6 0
1.63% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATC-- | ----------TGAGCTACTAGGTTGCCCTT D12 -2
1.35% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCC- | ATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D1 -1
1.15% AGCTCACCTCGATTTCTTC----------- | ----GGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D15 -11
1.07% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG T ATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT I1+T
0.96% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGA------ | -TTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D7 -6
0.90% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG A ATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT I1+A
0.85% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG CGATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT I2+CG
0.64% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAAT--- | ATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D3 -3
0.64% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG | -------GTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D7 0
0.63% AGCTCACCTCGATTTCTTCATA-------- | -TTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D9 -8
0.61% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG C ATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT I1+C
0.58% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG | --------TCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D8 0
0.53% AGCTCACCTCGATTTCTTC----------- | ----------TGAGCTACTAGGTTGCCCTT D21 -11
0.51% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG | ----GGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D4 0
0.46% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGA------ | -------------GCTACTAGGTTGCCCTT D19 -6
0.44% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG | A------------GCTACTAGGTTGCCCTT D12 1
0.42% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAG------- | --------------CTACTAGGTTGCCCTT D21 -7
0.41% AGCTCACCTCGATTTCT------------- | -----------GAGCTACTAGGTTGCCCTT D24 -13
0.41% AGCTCACCTCGATTTCTTCA---------- | -------------GCTACTAGGTTGCCCTT D23 -10
0.40% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG | ---CGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D3 0
0.37% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAA---- | ATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D4 -4
0.36% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG | ----------TGAGCTACTAGGTTGCCCTT D10 0
0.35% AGCTCACCTCGATTTC-------------- | ----GGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D18 -14
0.34% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG | A-------------------GGTTGCCCTT D19 1
0.33% AGCTCACCTCGATTTCTTCA---------- | ATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D10 -10
0.31% AGCTCACCTCGATTTCTT------------ | -------GTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D19 -12
0.28% AGCTCACCTCGATT---------------- | ---CGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D19 -16
0.28% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAG------- | -----GTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D12 -7
0.28% AGCTCACCTCGATTTCTT------------ | --TCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D14 -12
0.27% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG | ------------AGCTACTAGGTTGCCCTT D12 0
0.27% AGCTCACCTCGATTTCTTCATA-------- | ATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D8 -8
0.27% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG | ---------CTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D9 0
0.25% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATC-- | --TCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D4 -2
0.25% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG | -------------GCTACTAGGTTGCCCTT D13 0
0.24% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG ATATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT I2+AT
0.24% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG CAATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT I2+CA
0.24% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATC-- | -TTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D3 -2
0.23% AGCTCACCTCGATTTCTTCAT--------- | -----------GAGCTACTAGGTTGCCCTT D20 -9
0.22% AGCTCACCTCGATTTCTTCAT--------- | ---CGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D12 -9
0.21% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG GCATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT I2+GC
0.20% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG | A----------------CTAGGTTGCCCTT D16 1
0.20% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAAT--- | -TTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D4 -3
0.19% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCC- | ------------------TAGGTTGCCCTT D19 -1
0.19% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGA------ | ---------------TACTAGGTTGCCCTT D21 -6
0.19% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG | A-----TGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D5 1
0.19% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATC-- | -----GTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D7 -2
0.19% AGCTCACCTCGATTTCTT------------ | ATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D12 -12
0.18% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG | ---------------------GTTGCCCTT D21 0
0.17% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG | --------------CTACTAGGTTGCCCTT D14 0
0.17% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCC- | -TTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D2 -1
0.17% AGCTCACCTCGATTTCTT------------ | -----------GAGCTACTAGGTTGCCCTT D23 -12
0.16% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCC- | ----------TGAGCTACTAGGTTGCCCTT D11 -1
0.16% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG | -----------GAGCTACTAGGTTGCCCTT D11 0
0.16% AGCTCACCTCGATTTCT------------- | ---------CTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D22 -13
0.16% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG TTATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT I2+TT
0.16% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAAT--- | ----------------ACTAGGTTGCCCTT D19 -3
0.15% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG | A---------TGAGCTACTAGGTTGCCCTT D9 1
0.15% AGCTCACCTCGATTTCTTC----------- | ------------------TAGGTTGCCCTT D29 -11
0.15% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAAT--- | -------GTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D10 -3
0.15% AGCTCACCTCGATTTCTTCAT--------- | ---------CTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D18 -9
0.15% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCC- | ---------------TACTAGGTTGCCCTT D16 -1
0.14% AGCTCACCTCGATTTC-------------- | ATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D14 -14
0.14% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAAT--G | ATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D2 -3
0.14% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAA---- | ---CGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D7 -4
0.13% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCC- | --TCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D3 -1
0.12% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG | ---------------TACTAGGTTGCCCTT D15 0
0.12% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAG------- | --------TCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D15 -7
0.12% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAAT--- | -----------GAGCTACTAGGTTGCCCTT D14 -3
0.12% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG CCATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT I2+CC
0.12% AGCTCACCTCGATTTCT------------- | ---CGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D16 -13
0.12% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG | A----------------------TGCCCTT D22 1
0.11% AGCTCACCTCG------------------- | -----GTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D24 -19
0.11% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG TAATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT I2+TA
0.11% AGCTCACCTCGATTTCTTCATA-------- | -----------------CTAGGTTGCCCTT D25 -8
0.11% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAA----- | --TCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D7 -5
0.11% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAG------- | ---------------------GTTGCCCTT D28 -7
0.10% AGCTCACCTCGATTTCT------------- | -------GTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D20 -13
0.10% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG | A------GTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D6 1
0.10% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCC- | --------------------------CCTT D27 -1
0.10% AGCTCACCTCGATTT--------------- | --TCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D17 -15
0.09% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAA----- | --------------CTACTAGGTTGCCCTT D19 -5
0.09% AGCTCACCTCGATTTCTTCATA-------- | ------------AGCTACTAGGTTGCCCTT D20 -8
0.09% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG CTATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT I2+CT
0.09% AGCTCACCTCGATTTCT------------- | ATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D13 -13
0.09% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAA----G | ATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D4 -5
0.08% AGCTCACCTCGATTTCTTCAT--------- | -------GTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D16 -9
0.08% AGCTCACCTCGATTTCTT------------ | ----GGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D16 -12
0.08% AGCTCACCTCGATTTCTTC----------G | ATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D10 -11
0.08% AGCTCACCTCGATTTCT------------- | -----GTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D18 -13
0.08% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG | -----------------CTAGGTTGCCCTT D17 0
0.08% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAA---- | -----------------CTAGGTTGCCCTT D21 -4
0.08% AGCTCACCTCGATTT--------------- | -----------GAGCTACTAGGTTGCCCTT D26 -15
0.08% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATC-- | ---------------TACTAGGTTGCCCTT D17 -2
0.08% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAA--CG | ATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D2 -4
0.08% AGCTCACCTCGATT---------------- | ---------CTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D25 -16
0.08% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAG------G | ATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D6 -7
0.08% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGA------ | -----------------CTAGGTTGCCCTT D23 -6
0.07% AGCTCACCTCG------------------- | --------TCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D27 -19
0.07% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAA---G | ATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D3 -4
0.07% AGCTCACCTCGATTTCTTCA---------- | -----GTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D15 -10
0.07% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG | A--------CTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D8 1
0.07% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATC-- | ------------AGCTACTAGGTTGCCCTT D14 -2
0.07% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGA------ | -----GTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D11 -6
0.07% AGCTCACCTCGATTTCTTCAT--------G | ATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D8 -9
0.07% AGCTCACCTCGATTTCTTC----------- | ---------------TACTAGGTTGCCCTT D26 -11
0.07% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG TGATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT I2+TG
0.07% AGCTCACCTCGATTTCTT------------ | ------------AGCTACTAGGTTGCCCTT D24 -12
0.07% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGA------ | --------------------GGTTGCCCTT D26 -6
0.07% AGCTCACCTCGATTTCT------------- | ----------------ACTAGGTTGCCCTT D29 -13
0.07% AGCTCACCTCGATTTCTTCA---------- | -------------------AGGTTGCCCTT D29 -10
0.07% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAA----- | -------------GCTACTAGGTTGCCCTT D18 -5
0.07% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG | -------------------AGGTTGCCCTT D19 0
0.06% AGCTCACCTCGATTTCTTC----------- | --------TCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D19 -11
0.06% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG | A-------TCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D7 1
0.06% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATC-- | --------TCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D10 -2
0.06% AGCTCACCTCGATTTCTTCATA-------- | ---CGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D11 -8
0.06% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG | ----------------ACTAGGTTGCCCTT D16 0
0.06% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCC- | ---CGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D4 -1
0.06% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG AGATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT I2+AG
0.06% AGCTCACCTCGAT----------------- | ---------CTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D26 -17
0.06% AGCTCACCTCGATT---------------- | -------GTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D23 -16
0.06% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAG------- | ------TGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D13 -7
0.06% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAA----- | ----------TGAGCTACTAGGTTGCCCTT D15 -5
0.06% AGCTCACCTCGATTTCTTCA---------G | ATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D9 -10
0.06% AGCTCACCTCGAT----------------- | ---CGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D20 -17
0.06% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG AAATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT I2+AA
0.06% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAAT--- | ----GGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D7 -3
0.06% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG GGATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT I2+GG
0.06% AGCTCACCTCGAT----------------- | ATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D17 -17
0.06% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG | --------------------GGTTGCCCTT D20 0
0.05% AGCTCACCTCGATTTC-------------- | -----GTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D19 -14
0.05% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG | A--CGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D2 1
0.05% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGA------ | --TCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D8 -6
0.05% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGA-----G | ATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D5 -6
0.05% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG ACATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT I2+AC
0.05% AGCTCACCTCGATT---------------- | ATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D16 -16
0.05% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCC- | ----------------ACTAGGTTGCCCTT D17 -1
0.05% AGCTCACCTCGATTTCTTC----------- | -------------GCTACTAGGTTGCCCTT D24 -11
0.05% AGCTCACCTCGATTT--------------- | ATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D15 -15
0.05% AGCTCACCTCGATT---------------- | -----------GAGCTACTAGGTTGCCCTT D27 -16
0.05% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCC- | --------TCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D9 -1
0.05% AGCTCACCTCGATTTCTTCA---------- | -----------------CTAGGTTGCCCTT D27 -10
0.05% AGCTCACCTCGATTT--------------- | -------GTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D22 -15
0.05% AGCTCACCTCGATTTCTTCA---------- | -----------GAGCTACTAGGTTGCCCTT D21 -10
0.05% AGCTCACCTCGATTTCTT------------ | ----------TGAGCTACTAGGTTGCCCTT D22 -12
0.05% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAA----- | --------TCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D13 -5
0.05% AGCTCACCTCGATTTCTTCATA-------- | ----------TGAGCTACTAGGTTGCCCTT D18 -8
0.05% AGCTCACCTCGATTTCTT------------ | --------TCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D20 -12
0.05% AGCTCACCTCGATTTCTTCAT--------- | -TTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D10 -9
0.05% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAA----- | --------------------GGTTGCCCTT D25 -5
0.05% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG | ----------------------TTGCCCTT D22 0
0.05% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG GAATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT I2+GA
0.05% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG | -------------------------CCCTT D25 0
0.05% AGCTCACCTCGATTTCT------------G | ATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D12 -13
0.05% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCC- | ------TGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D7 -1
0.05% AGCTCACCTCGATTTCT------------- | -------------GCTACTAGGTTGCCCTT D26 -13
0.05% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAA----- | ------------------TAGGTTGCCCTT D23 -5
0.04% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAA----- | ---------------------GTTGCCCTT D26 -5
0.04% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAA----- | -----------GAGCTACTAGGTTGCCCTT D16 -5
0.04% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG | A----------GAGCTACTAGGTTGCCCTT D10 1
0.04% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAG------- | ----GGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D11 -7
0.04% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGA------ | ----------------------TTGCCCTT D28 -6
0.04% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG GTATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT I2+GT
0.04% AGCTCACCTCGAT----------------- | -----------GAGCTACTAGGTTGCCCTT D28 -17
0.04% AGCTCACCTCGAT----------------- | -------GTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D24 -17
0.04% AGCTCACCTCGATTTCTT-----------G | ATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D11 -12
0.04% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG | A---GGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D3 1
0.04% AGCTCACCT--------------------- | --TCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D23 -21
0.04% AGCTCACCT--------------------G | ATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D20 -21
0.04% AGCTCACCTCG------------------- | ------TGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D25 -19
0.04% AGCTCACCTCGATTTCTT------------ | -TTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D13 -12
0.04% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAAT--- | -----------------------TGCCCTT D26 -3
0.04% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATC-- | ------------------TAGGTTGCCCTT D20 -2
0.04% AGCTCACCTCGATTTCTT------------ | ----------------ACTAGGTTGCCCTT D28 -12
0.04% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG TCATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT I2+TC
0.04% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAAT--- | -------------------AGGTTGCCCTT D22 -3
0.04% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAG------- | -TTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D8 -7
0.04% AGCTCACCTCGATTTCTTCAT--------- | --------------CTACTAGGTTGCCCTT D23 -9
0.04% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG | -----------------------TGCCCTT D23 0
0.04% AGCTCACCTCGA------------------ | ATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D18 -18
0.04% AGCTCACCTCGATTT--------------- | --------TCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D23 -15
0.04% AGCTCACCTCGATTTCTTC----------- | -TTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D12 -11
0.04% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG | A--------------TACTAGGTTGCCCTT D14 1
0.04% AGCTCACCTCGATTTCTTCAT--------- | -----GTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D14 -9
0.04% AGCTCACCTCGATTTCTTCA---------- | --------------CTACTAGGTTGCCCTT D24 -10
0.03% AGCTCACCTCGATTTCTTCATA-------- | --------TCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D16 -8
0.03% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAAT--- | ------TGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D9 -3
0.03% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAAT--- | ---------------TACTAGGTTGCCCTT D18 -3
0.03% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATC-- | -------GTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D9 -2
0.03% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAA---- | ---------CTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D13 -4
0.03% AGCTCACCTCGATTTC-------------- | ------------AGCTACTAGGTTGCCCTT D26 -14
0.03% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAA---- | ----GGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D8 -4
0.03% AGCTCACCTCGATTTCTT------------ | -----GTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D17 -12
0.03% AGCTCACCTCGATTTCTTC----------- | ---CGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D14 -11
0.03% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAG------- | ---------CTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D16 -7
0.03% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAA----- | ------TGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D11 -5
0.03% AGCTCACCTCGATTTCT------------- | ------------AGCTACTAGGTTGCCCTT D25 -13
0.03% AGCTCACCTCGATTTCTTCATA-------- | ---------CTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D17 -8
0.03% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAG------- | --TCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D9 -7
0.03% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG | ------------------TAGGTTGCCCTT D18 0
0.03% AGCTCACCTCGATTT--------------- | ----GGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D19 -15
0.03% AGCTCACCTCGATTTCTTCA---------- | ----GGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D14 -10
0.03% AGCTCACCTCGATTTCT------------- | ----GGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D17 -13
0.03% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAAT--- | ------------------------GCCCTT D27 -3
0.03% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGA------ | ---------CTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D15 -6
0.03% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG | A----GTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D4 1
0.03% AGCTCACCTCGATTT--------------- | ----------TGAGCTACTAGGTTGCCCTT D25 -15
0.03% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATC-- | ------TGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D8 -2
0.03% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAG------- | ------------------TAGGTTGCCCTT D25 -7
0.03% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAA---CG | ATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D3 -5
0.03% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAAT--- | -----GTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D8 -3
0.03% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAA---- | --------------------GGTTGCCCTT D24 -4
0.03% AGCTCACCTCGA-----------------G | ATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D17 -18
0.03% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAA----- | -----------------CTAGGTTGCCCTT D22 -5
0.03% AGCTCACCTCGATT---------------- | ------------AGCTACTAGGTTGCCCTT D28 -16
0.03% AGCTCACCTCGATTTCTTC----------- | -----------GAGCTACTAGGTTGCCCTT D22 -11
0.03% AGCTCACCTCGATTTCTT------------ | -------------GCTACTAGGTTGCCCTT D25 -12
0.03% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG | A-TCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D1 1
0.03% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAG------- | ----------------------TTGCCCTT D29 -7
0.03% AGCTCACCTCG------------------- | -------GTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D26 -19
0.03% AGCTCACC---------------------- | ----GGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D26 -22
0.03% AGCTCACCTCGATTT--------------- | ------------AGCTACTAGGTTGCCCTT D27 -15
0.03% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCC- | ---------CTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D10 -1
0.03% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATC-- | --------------------GGTTGCCCTT D22 -2
0.03% AGCTCACCTCGATTTCTTCATA-------- | -------------------AGGTTGCCCTT D27 -8
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0.02% AGCTCACCTCGATTTCTTCAT--------- | ----GGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D13 -9
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0.01% AGCTCACCTCGATTTCTTCA---------- | ---CGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D13 -10
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0.01% AGCTCACCTCGATTTCTTCAT--------- | -------------GCTACTAGGTTGCCCTT D22 -9
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0.01% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAA---- | --------------CTACTAGGTTGCCCTT D18 -4
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0.01% AGCTCACCTCGATTTCTTCATA------CG | ATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D6 -8
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0.01% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAA----- | -----GTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D10 -5
0.01% AGCTCACCTCGAT----------------- | -----GTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D22 -17
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0.01% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCC- | ----------------------TTGCCCTT D23 -1
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0.01% AGCTCACCTCGATTTC-------------- | -----------GAGCTACTAGGTTGCCCTT D25 -14
0.01% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAA----- | -------GTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D12 -5
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0.01% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAA----- | ---------CTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D14 -5
0.01% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGA------ | --------TCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D14 -6
0.01% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGA----CG | ATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D4 -6
0.01% AGCTCACCTCGATTTCTTCAT-------CG | ATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D7 -9
0.01% AGCTCACC---------------------- | -----GTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D27 -22
0.01% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAG-----CG | ATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D5 -7
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0.01% AGCTCACCTCGATTT--------------- | -------------GCTACTAGGTTGCCCTT D28 -15
0.01% AGCTCACCTCGATTTCTTCAT--------- | ---------------TACTAGGTTGCCCTT D24 -9
0.01% AGCTCACCTCGATTTCTTCATA-------- | ----------------ACTAGGTTGCCCTT D24 -8
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0.01% AGCTCACCT--------------------- | -----GTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D26 -21
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0.01% AGCTCACCTCGATTTCTTCA--------CG | ATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D8 -10
0.01% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCC- | -------------------AGGTTGCCCTT D20 -1
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0.01% AGCTCACCT--------------------- | --------TCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D29 -21
0.01% AGCTCACCTCGATTTCTTC----------- | --TCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D13 -11
0.01% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAG------- | -----------------CTAGGTTGCCCTT D24 -7
0.01% AGCTCAC----------------------G | ATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D22 -23
0.01% AGCTCAC----------------------- | --TCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D25 -23
0.01% AGCTCACCTCGAT----------------- | ----GGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D21 -17
0.01% AGCTCACCTCGATTT--------------- | ------TGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D21 -15
0.01% AGCTCACCTCGATTTCTTCATA-------- | --------------CTACTAGGTTGCCCTT D22 -8
0.01% AGCTCACCTCGATTTCTT------------ | ---------------TACTAGGTTGCCCTT D27 -12
0.01% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATC-- | ----------------ACTAGGTTGCCCTT D18 -2
0.01% AGCTCAC----------------------- | -----GTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D28 -23
0.01% AGCTCAC----------------------- | -TTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D24 -23
0.01% AGCTCA------------------------ | --TCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D26 -24
0.01% AGCTCACCTCGATTTC-------------- | --------------CTACTAGGTTGCCCTT D28 -14
0.01% AGCTCACCTCG------------------- | --TCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D21 -19
0.01% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGA------ | -------GTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D13 -6
0.01% AGCTCACCTC-------------------- | --TCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D22 -20
0.01% AGCTCACCT--------------------- | ----GGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D25 -21
0.01% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAA---- | ------------AGCTACTAGGTTGCCCTT D16 -4
0.01% AGCTCACCTCGATTTCTTCA---------- | -------GTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D17 -10
0.01% AGCTCACCTCG-----------------CG | ATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D17 -19
0.01% AGCTCACCTCGA------------------ | ----GGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D22 -18
0.01% AGCTCACCTCGATTTC-------------- | -------------GCTACTAGGTTGCCCTT D27 -14
0.01% AGCTCACCTCGATTTCTTCAT--------- | --------------------GGTTGCCCTT D29 -9
0.01% AGCTCACC---------------------G | ATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D21 -22
0.01% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAA----- | -----------------------TGCCCTT D28 -5
0.01% AGCTCACCTCG------------------- | ----GGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D23 -19
0.01% AGCTC------------------------- | -TTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D26 -25
0.01% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAAT--- | ----------------------TTGCCCTT D25 -3
0.01% AGCT-------------------------- | --TCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D28 -26
0.01% AGCTCACCTCGATT--------------CG | ATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D14 -16
0.01% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAA---- | -------------------------CCCTT D29 -4
0.01% AGCTCACCTCGATTTCTTCATA-------- | ------------------TAGGTTGCCCTT D26 -8
0.01% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGA------ | -----------------------TGCCCTT D29 -6
0.01% AGCTC------------------------G | ATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D24 -25
0.01% AGCTCACCTCGATTTC------------CG | ATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D12 -14
0.01% AGCTCACCTCGATTTCTTC----------- | ------TGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D17 -11
0.01% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAA---- | ------------------------GCCCTT D28 -4
0.01% AGCTCACCT--------------------- | -------GTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D28 -21
0.01% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG | A-----------------------GCCCTT D23 1
0.01% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAAT--- | ---------------------GTTGCCCTT D24 -3
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0.01% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATC-G | ATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D1 -2
0.01% AGCTCACCTCGATTTC-------------- | ---------CTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D23 -14
0.01% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG | A------------------------CCCTT D24 1
0.01% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAG------- | --------------------GGTTGCCCTT D27 -7
0.01% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAA---- | -------GTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D11 -4
0.01% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCC- | -------------------------CCCTT D26 -1
0.01% AGCTCACC--------------------CG | ATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D20 -22
0.01% AGCTCAC----------------------- | ------TGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D29 -23
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0.01% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAG------- | -------------GCTACTAGGTTGCCCTT D20 -7
0.01% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAA----- | ------------------------GCCCTT D29 -5
0.01% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG | A-------------------------CCTT D25 1
0.01% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAG------- | ----------TGAGCTACTAGGTTGCCCTT D17 -7
0.01% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGA------ | --------------CTACTAGGTTGCCCTT D20 -6
0.01% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATC-- | ---------------------GTTGCCCTT D23 -2
0.01% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATC-- | -----------------------TGCCCTT D25 -2
0.01% AGCTCACCTC------------------CG | ATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D18 -20
0.00% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG | A-------------CTACTAGGTTGCCCTT D13 1
0.00% AGCTCACCTCGAT---------------CG | ATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D15 -17
0.00% AGCTCA------------------------ | ----GGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D28 -24
0.00% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG | A------------------AGGTTGCCCTT D18 1
0.00% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAA----- | ----------------------TTGCCCTT D27 -5
0.00% AGCTCACCTCGA----------------CG | ATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D16 -18
0.00% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAAT--- | ------------AGCTACTAGGTTGCCCTT D15 -3
0.00% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG | A---------------ACTAGGTTGCCCTT D15 1
0.00% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG | ----------------------------TT D28 0
0.00% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG | ---------------------------CTT D27 0
0.00% AGCTC------------------------- | --TCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D27 -25
0.00% AGCTC------------------------- | ---CGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D28 -25
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0.00% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAG------- | ---------------TACTAGGTTGCCCTT D22 -7
0.00% AGCTCACCT-------------------CG | ATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D19 -21
0.00% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG | A--------------------GTTGCCCTT D20 1
0.00% AGCT-------------------------G | ATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D25 -26
0.00% AGCT-------------------------- | -TTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D27 -26
0.00% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAA---- | ----------------ACTAGGTTGCCCTT D20 -4
0.00% AGC--------------------------G | ATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D26 -27
0.00% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG | -----------------------------T D29 0
0.00% AG---------------------------- | -TTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D29 -28
0.00% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAAT--- | -------------GCTACTAGGTTGCCCTT D16 -3
0.00% AGCTC-----------------------CG | ATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D23 -25
0.00% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGA------ | ---------------------GTTGCCCTT D27 -6
0.00% AG---------------------------- | ATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D28 -28
0.00% A---------------------------CG | ATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D27 -29
0.00% AGC--------------------------- | ATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D27 -27
0.00% A----------------------------- | ATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D29 -29
0.00% AG---------------------------G | ATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D27 -28
0.00% -----------------------------G | ATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D29 -30
0.00% AGC-------------------------CG | ATTCGGTGTCTGAGCTACTAGGTTGCCCTT D25 -27
0.00% AGCTCACCTCGATTTCTTCATAGAAATCCG | A----------------------------T D28 1
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