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DNA break repair outcome predictions

Guide: CCCTCTGGAGAGTCCGGGGA TGG

The following table lists possible deletions and insertions, scored by the Lindel repair model.
Each sequence below represents the context around the guide's target, with deleted nucleotides shown as "-".
Sequences are ranked by their probability, as predicted by the method of Chen et al. 2019.

Probability Sequence Effect
TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG | GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT wild-type
18.30% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAG----- | ----------CCGAAAGGACATGGTTATGT D15 -5
7.56% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG | --ATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D2 0
6.75% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG X GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT I3+X
6.39% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGA------ | ---TGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D9 -6
6.04% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGA-------- | ---TGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D11 -8
5.99% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG | ------AGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D6 0
5.22% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG | -GATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D1 0
3.60% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCC-G | GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D1 -2
2.36% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCG- | -------------AAAGGACATGGTTATGT D14 -1
1.92% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG | G-----AGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D5 1
1.69% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTC--- | ------------GAAAGGACATGGTTATGT D15 -3
1.69% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAG----- | --------AGCCGAAAGGACATGGTTATGT D13 -5
1.47% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAG----- | -GATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D6 -5
1.35% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG T GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT I1+T
1.35% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCG- | --ATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D3 -1
0.94% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGG--------- | -GATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D10 -9
0.87% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTC--- | GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D3 -3
0.80% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG GGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT I2+GG
0.79% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG A GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT I1+A
0.75% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG | G---------CCGAAAGGACATGGTTATGT D9 1
0.71% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG | --------AGCCGAAAGGACATGGTTATGT D8 0
0.66% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTG---------- | --ATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D12 -10
0.62% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCC-- | -----------CGAAAGGACATGGTTATGT D13 -2
0.62% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG | ----------CCGAAAGGACATGGTTATGT D10 0
0.56% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAG------- | ----------CCGAAAGGACATGGTTATGT D17 -7
0.55% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG G GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT I1+G
0.51% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAG----- | --ATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D7 -5
0.46% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT---- | ----GGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D8 -4
0.43% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAG------- | -GATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D8 -7
0.42% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAG----- | GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D5 -5
0.41% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAG----- | -----GAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D10 -5
0.40% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG C GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT I1+C
0.37% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAG------- | GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D7 -7
0.35% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG | ------------------ACATGGTTATGT D18 0
0.35% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG | G-------AGCCGAAAGGACATGGTTATGT D7 1
0.33% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG | --------------AAGGACATGGTTATGT D14 0
0.30% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG | ---TGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D3 0
0.29% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGG--------- | GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D9 -9
0.28% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG | ---------------AGGACATGGTTATGT D15 0
0.27% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG | -------------AAAGGACATGGTTATGT D13 0
0.25% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT---- | GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D4 -4
0.25% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG | -----------CGAAAGGACATGGTTATGT D11 0
0.24% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCG- | ----------CCGAAAGGACATGGTTATGT D11 -1
0.24% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAG----- | ------AGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D11 -5
0.23% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG TTGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT I2+TT
0.22% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTC--G | GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D2 -3
0.22% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG | G--TGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D2 1
0.21% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTC--- | --------------------ATGGTTATGT D23 -3
0.20% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG | ---------GCCGAAAGGACATGGTTATGT D9 0
0.20% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGA------ | --------------AAGGACATGGTTATGT D20 -6
0.20% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCG- | --------AGCCGAAAGGACATGGTTATGT D9 -1
0.19% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTG---------- | -------------AAAGGACATGGTTATGT D23 -10
0.19% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG TGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT I2+TG
0.19% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCC-- | -------------AAAGGACATGGTTATGT D15 -2
0.19% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCG- | ------AGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D7 -1
0.19% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG | -------GAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D7 0
0.18% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGA-------- | --------------AAGGACATGGTTATGT D22 -8
0.17% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT---- | -----GAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D9 -4
0.17% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTG---------- | --------AGCCGAAAGGACATGGTTATGT D18 -10
0.17% TTTCCCCCTCCCCCCCT------------- | ----GGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D17 -13
0.17% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT---- | -------GAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D11 -4
0.15% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG AAGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT I2+AA
0.15% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG | -----------------------GTTATGT D23 0
0.15% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG CGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT I2+CG
0.15% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAG----- | -----------------GACATGGTTATGT D22 -5
0.15% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT---- | --ATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D6 -4
0.14% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAG------G | GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D6 -7
0.14% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGA-------- | ---------------AGGACATGGTTATGT D23 -8
0.14% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGG--------- | ----------CCGAAAGGACATGGTTATGT D19 -9
0.14% TTTCCCCCTCCCCCCCTC------------ | GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D12 -12
0.13% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTC--- | -GATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D4 -3
0.13% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAG------- | -----GAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D12 -7
0.13% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG | G-----------------ACATGGTTATGT D17 1
0.13% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTC--- | ------AGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D9 -3
0.13% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT---- | -GATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D5 -4
0.13% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGA-------- | -------------------CATGGTTATGT D27 -8
0.12% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG | -----GAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D5 0
0.12% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGG--------- | -----GAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D14 -9
0.12% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG | G----------CGAAAGGACATGGTTATGT D10 1
0.11% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGA------ | ---------------------TGGTTATGT D27 -6
0.11% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG ATGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT I2+AT
0.11% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTG---------- | ----------CCGAAAGGACATGGTTATGT D20 -10
0.11% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG TAGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT I2+TA
0.10% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAG------- | ----GGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D11 -7
0.10% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGA------ | -----------CGAAAGGACATGGTTATGT D17 -6
0.10% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGA------ | -------------------CATGGTTATGT D25 -6
0.10% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG | ----GGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D4 0
0.10% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCG- | --------------AAGGACATGGTTATGT D15 -1
0.10% TTTCCCCCTCCCCCCC-------------- | GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D14 -14
0.10% TTTCCCCCTCCCCCCC-------------- | ------------GAAAGGACATGGTTATGT D26 -14
0.10% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCG- | ---TGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D4 -1
0.09% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTC--- | ---TGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D6 -3
0.09% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG | G----------------GACATGGTTATGT D16 1
0.09% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAG----G | GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D4 -5
0.09% TTTCCCCCTCCCCCCCT------------- | -------------AAAGGACATGGTTATGT D26 -13
0.09% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT---G | GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D3 -4
0.09% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTC--- | --ATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D5 -3
0.09% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCC-- | --------AGCCGAAAGGACATGGTTATGT D10 -2
0.09% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAG------- | ---TGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D10 -7
0.08% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCC-- | --ATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D4 -2
0.08% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG | G------GAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D6 1
0.08% TTTCCCCCTCCCCCCCTC------------ | ------------GAAAGGACATGGTTATGT D24 -12
0.08% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT---- | ------------------ACATGGTTATGT D22 -4
0.08% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAG----- | ---------------AGGACATGGTTATGT D20 -5
0.08% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG AGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT I2+AG
0.08% TTTCCCCCTCCCCCCCT------------- | GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D13 -13
0.07% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGA-------- | ----------CCGAAAGGACATGGTTATGT D18 -8
0.07% TTTCCCCCTCCCCCC--------------- | ------------GAAAGGACATGGTTATGT D27 -15
0.07% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG CAGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT I2+CA
0.07% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGG--------G | GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D8 -9
0.07% TTTCCCCCTCCCCCCCT------------- | ------------GAAAGGACATGGTTATGT D25 -13
0.07% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAG------- | -----------------GACATGGTTATGT D24 -7
0.07% TTTCCCCCTCCCCCCCTC------------ | ---TGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D15 -12
0.07% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCC-- | ---------------------TGGTTATGT D23 -2
0.07% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG | G------------AAAGGACATGGTTATGT D12 1
0.07% TTTCCCCCTCCCCCCC-------------- | -----------CGAAAGGACATGGTTATGT D25 -14
0.07% TTTCCCCCTCCCCCCCTC------------ | -----------CGAAAGGACATGGTTATGT D23 -12
0.07% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCC-- | ---TGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D5 -2
0.07% TTTCCCCCTCCCCCC--------------- | GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D15 -15
0.06% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT--GG | GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D2 -4
0.06% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAG----- | ------------------ACATGGTTATGT D23 -5
0.06% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG | -------------------CATGGTTATGT D19 0
0.06% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG CTGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT I2+CT
0.06% TTTCCCCCTCCCCC---------------- | ------------GAAAGGACATGGTTATGT D28 -16
0.06% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG | ------------------------TTATGT D24 0
0.06% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT---- | ------AGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D10 -4
0.06% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCG- | -----------CGAAAGGACATGGTTATGT D12 -1
0.05% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGA------ | --ATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D8 -6
0.05% TTTCCCCCTCCCCCCCTC------------ | -GATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D13 -12
0.05% TTTCCCCCTCCCCCCCT------------G | GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D12 -13
0.05% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGA-------- | --ATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D10 -8
0.05% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTC--- | -------GAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D10 -3
0.05% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGG--------- | ---TGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D12 -9
0.05% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAG----- | -------------AAAGGACATGGTTATGT D18 -5
0.05% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGA------ | ---------------AGGACATGGTTATGT D21 -6
0.05% TTTCCCCCTCCCCCCCTC------------ | --ATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D14 -12
0.05% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGG--------- | -----------------GACATGGTTATGT D26 -9
0.05% TTTCCCCCTCCCCCCCTC------------ | -----GAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D17 -12
0.05% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCC-- | ------AGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D8 -2
0.05% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTG---------- | ------------------ACATGGTTATGT D28 -10
0.04% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG GAGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT I2+GA
0.04% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG ACGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT I2+AC
0.04% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTC--- | --------AGCCGAAAGGACATGGTTATGT D11 -3
0.04% TTTCCCCCTCCCCC---------------- | GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D16 -16
0.04% TTTCCCCCTCCCC----------------- | GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D17 -17
0.04% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTG---------- | -----GAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D15 -10
0.04% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT---- | ---TGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D7 -4
0.04% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAG----- | ----GGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D9 -5
0.04% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT---- | ---------GCCGAAAGGACATGGTTATGT D13 -4
0.04% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG | ----------------------GGTTATGT D22 0
0.04% TTTCCCCCTCCCCCCCTC-----------G | GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D11 -12
0.04% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG | -----------------GACATGGTTATGT D17 0
0.04% TTTCCCCCTCCCCCCCTC------------ | -------GAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D19 -12
0.04% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAG----- | -----------------------GTTATGT D28 -5
0.04% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGG--------- | -----------CGAAAGGACATGGTTATGT D20 -9
0.04% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTC--- | ----GGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D7 -3
0.04% TTTCCCCCTCCCCCCC-------------- | -GATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D15 -14
0.03% TTTCCCCCTCCCC----------------- | ------------GAAAGGACATGGTTATGT D29 -17
0.03% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG | G----------------------GTTATGT D22 1
0.03% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT---- | ----------------------GGTTATGT D26 -4
0.03% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGA-------- | ---------------------TGGTTATGT D29 -8
0.03% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGA------ | ------------------ACATGGTTATGT D24 -6
0.03% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCC-- | --------------------ATGGTTATGT D22 -2
0.03% TTTCCCCCTCCCCCCCT------------- | --ATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D15 -13
0.03% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGG--------- | ---------GCCGAAAGGACATGGTTATGT D18 -9
0.03% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG | ----------------GGACATGGTTATGT D16 0
0.03% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCG- | ------------------------TTATGT D25 -1
0.03% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG | G-------------AAGGACATGGTTATGT D13 1
0.03% TTTCCCCCTCCC------------------ | GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D18 -18
0.03% TTTCCCCCTCCCCCCCTC------------ | ----GGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D16 -12
0.03% TTTCCCCCTCCC-----------------G | GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D17 -18
0.03% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG | G-------------------ATGGTTATGT D19 1
0.03% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTC--- | -----GAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D8 -3
0.03% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG | --------------------ATGGTTATGT D20 0
0.03% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG | G----GAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D4 1
0.03% TTTCCCCCTCCCCCCCT------------- | -GATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D14 -13
0.03% TTTCCCCCTCCCCCCCTCT----------- | -------------AAAGGACATGGTTATGT D24 -11
0.03% TTTCCCCCT--------------------G | GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D20 -21
0.03% TTTCCCCCT--------------------- | ----GGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D25 -21
0.03% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTG---------- | --------------AAGGACATGGTTATGT D24 -10
0.03% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAG----- | -------GAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D12 -5
0.03% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAG---GG | GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D3 -5
0.03% TTTCCCCCTCCCCCCCTC------------ | ---------GCCGAAAGGACATGGTTATGT D21 -12
0.02% TTTCCCCCTCCCC----------------G | GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D16 -17
0.02% TTTCCCCCTCC------------------- | GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D19 -19
0.02% TTTCCCCCTCCCCCCCT------------- | -----GAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D18 -13
0.02% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG | ------------GAAAGGACATGGTTATGT D12 0
0.02% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGG--------- | -------------------CATGGTTATGT D28 -9
0.02% TTTCCCCCTCCCCCCCT-----------GG | GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D11 -13
0.02% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGG--------- | -------GAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D16 -9
0.02% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG CCGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT I2+CC
0.02% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG | G--------GCCGAAAGGACATGGTTATGT D8 1
0.02% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCC-- | ----------CCGAAAGGACATGGTTATGT D12 -2
0.02% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTC--- | --------------AAGGACATGGTTATGT D17 -3
0.02% TTTCCCCCTCCCCCCCTCT----------- | --ATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D13 -11
0.02% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGA-------- | --------------------ATGGTTATGT D28 -8
0.02% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCG- | ---------------------TGGTTATGT D22 -1
0.02% TTTCCCCCTCCCCCCCTCT----------- | ---TGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D14 -11
0.02% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGG--------- | ----GGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D13 -9
0.02% TTTCCCCCTCCCCCC--------------G | GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D14 -15
0.02% TTTCCCCCTCCCCCC--------------- | -------------AAAGGACATGGTTATGT D28 -15
0.02% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTG---------- | ------AGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D16 -10
0.02% TTTCCCCCTCCCCCCC-------------- | -------GAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D21 -14
0.02% TTTCCCCCTCCCCCCCTC------------ | -----------------GACATGGTTATGT D29 -12
0.02% TTTCCCCCTCC------------------- | -------GAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D26 -19
0.02% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG GTGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT I2+GT
0.02% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT---- | -------------------------TATGT D29 -4
0.02% TTTCCCCCTCCCCCCCTCT----------- | ----------CCGAAAGGACATGGTTATGT D21 -11
0.02% TTTCCCCCTCCCCCCCTC------------ | ----------CCGAAAGGACATGGTTATGT D22 -12
0.02% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAG------- | ---------GCCGAAAGGACATGGTTATGT D16 -7
0.02% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTC--- | ---------GCCGAAAGGACATGGTTATGT D12 -3
0.02% TTTCCCCCTCCCCCCCT------------- | --------AGCCGAAAGGACATGGTTATGT D21 -13
0.02% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCC-- | -------------------------TATGT D27 -2
0.02% TTTCCCCCTCCCCCCCT------------- | ---TGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D16 -13
0.02% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTG---------- | -------------------CATGGTTATGT D29 -10
0.02% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGA-------- | ------AGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D14 -8
0.02% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAG------- | ----------------GGACATGGTTATGT D23 -7
0.02% TTTCCCCCTCCCCCCCTC------------ | --------AGCCGAAAGGACATGGTTATGT D20 -12
0.02% TTTCCCCCTC-------------------- | GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D20 -20
0.02% TTTCCCCCTCCCCCCC-------------- | -----GAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D19 -14
0.02% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAG----- | ------------GAAAGGACATGGTTATGT D17 -5
0.02% TTTCCCCCTCCCCCC--------------- | --------AGCCGAAAGGACATGGTTATGT D23 -15
0.02% TTTCCCCCTCC------------------- | --------AGCCGAAAGGACATGGTTATGT D27 -19
0.02% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG | G-ATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D1 1
0.02% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG | G--------------AGGACATGGTTATGT D14 1
0.02% TTTCCCCCTCCCCCCCTC------------ | ------AGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D18 -12
0.02% TTTCCCCCTCCCCCCC-------------G | GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D13 -14
0.02% TTTCCCCCTCCCCCC--------------- | -GATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D16 -15
0.02% TTTCCCCCTCCCCCCC-------------- | -------------AAAGGACATGGTTATGT D27 -14
0.02% TTTCCCCCTCCCCC---------------G | GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D15 -16
0.02% TTTCCCCCTCCCC----------------- | ------AGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D23 -17
0.02% TTTCCCCCTCCCCCCCTCT----------- | ------------------ACATGGTTATGT D29 -11
0.02% TTTCCCCCTCCCCC---------------- | ---------GCCGAAAGGACATGGTTATGT D25 -16
0.02% TTTCCCCCTCC------------------- | ---TGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D22 -19
0.02% TTTCCCCCTCCCCCCC-------------- | ----GGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D18 -14
0.02% TTTCCCCCTCCCCCCCT------------- | -------GAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D20 -13
0.01% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT---- | ------------GAAAGGACATGGTTATGT D16 -4
0.01% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAG----- | -----------CGAAAGGACATGGTTATGT D16 -5
0.01% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG TCGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT I2+TC
0.01% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAG------- | -----------CGAAAGGACATGGTTATGT D18 -7
0.01% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCC-- | ---------------------------TGT D29 -2
0.01% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGA-------- | ------------------ACATGGTTATGT D26 -8
0.01% TTTCCCCCTCCCCCCCT------------- | --------------AAGGACATGGTTATGT D27 -13
0.01% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGA-------- | -----------CGAAAGGACATGGTTATGT D19 -8
0.01% TTTCCCCCTCCCCC---------------- | -------------AAAGGACATGGTTATGT D29 -16
0.01% TTTCCCCCTCCCCCCCTCT----------- | --------------AAGGACATGGTTATGT D25 -11
0.01% TTTCCCCCTCCCCCCCTCT----------- | ----GGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D15 -11
0.01% TTTCCCCCTCCCCCCCTC----------GG | GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D10 -12
0.01% TTTCCCCCTCCCCCCCTC------------ | -------------AAAGGACATGGTTATGT D25 -12
0.01% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGA------ | ------AGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D12 -6
0.01% TTTCCCCCTCC------------------- | -GATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D20 -19
0.01% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAG------- | -------GAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D14 -7
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0.01% TTTCCCCCTCCCCCCCT------------- | ---------GCCGAAAGGACATGGTTATGT D22 -13
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0.01% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAG----- | -------------------CATGGTTATGT D24 -5
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0.01% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG | -------------------------TATGT D25 0
0.01% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTG---------- | ---TGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D13 -10
0.01% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCG- | --------------------ATGGTTATGT D21 -1
0.01% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG | G------------------CATGGTTATGT D18 1
0.01% TTTCCCCCTCCCCCC--------------- | ---------GCCGAAAGGACATGGTTATGT D24 -15
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0.01% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGG--------- | ------------GAAAGGACATGGTTATGT D21 -9
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0.01% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTG---------- | -----------CGAAAGGACATGGTTATGT D21 -10
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0.01% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT---- | --------AGCCGAAAGGACATGGTTATGT D12 -4
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0.01% TTTCCCCCTCCCCCCCTCT----------- | -----------CGAAAGGACATGGTTATGT D22 -11
0.01% TTTCCCCCTCC------------------- | -----GAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D24 -19
0.01% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT---- | -----------------------GTTATGT D27 -4
0.01% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCG- | ------------------ACATGGTTATGT D19 -1
0.01% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAG----- | --------------------ATGGTTATGT D25 -5
0.01% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGA-------- | --------AGCCGAAAGGACATGGTTATGT D16 -8
0.01% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCC-- | ------------------------TTATGT D26 -2
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0.01% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGG-------GG | GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D7 -9
0.01% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTC--- | -------------------------TATGT D28 -3
0.01% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG | G---------------GGACATGGTTATGT D15 1
0.01% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAG----- | ----------------------GGTTATGT D27 -5
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0.01% TTTCCCCCTCCCCCCC-------------- | ------AGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D20 -14
0.01% TTTCCCCCTCCCCC---------------- | ---TGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D19 -16
0.01% TTTCCCCCTCCCCC---------------- | -------GAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D23 -16
0.01% TTTCCCCCTC-------------------G | GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D19 -20
0.01% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT---- | -------------AAAGGACATGGTTATGT D17 -4
0.01% TTTCCCCCTCCCC----------------- | --------AGCCGAAAGGACATGGTTATGT D25 -17
0.01% TTTCCCCCTCC------------------- | ------AGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D25 -19
0.01% TTTCCC------------------------ | GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D24 -24
0.01% TTTCCCCCTCCCC----------------- | ---------GCCGAAAGGACATGGTTATGT D26 -17
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0.01% TTTCCCCCTCC-----------------GG | GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D17 -19
0.01% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGA------ | --------AGCCGAAAGGACATGGTTATGT D14 -6
0.01% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG | G-----------------------TTATGT D23 1
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0.01% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG | ---------------------TGGTTATGT D21 0
0.01% TTTCCCCCTCC------------------G | GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D18 -19
0.01% TTTCCCCCTCCCCCC--------------- | --------------AAGGACATGGTTATGT D29 -15
0.01% TTTCCCCCTCCCCCCCTCT----------- | ------AGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D17 -11
0.01% TTTCCCCCTCCCCCCCT------------- | ------AGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D19 -13
0.01% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAG-----GG | GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D5 -7
0.01% TTTCCCCCTC-------------------- | ---TGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D23 -20
0.01% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCG- | --------------------------ATGT D27 -1
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0.01% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG | G------------------------TATGT D24 1
0.01% TTTCCCCCTCCC------------------ | -------GAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D25 -18
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0.01% TTTCCCCC---------------------- | -GATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D23 -22
0.01% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAG----- | ---------GCCGAAAGGACATGGTTATGT D14 -5
0.01% TTTCCCCCTCCCCCCCTC------------ | ---------------AGGACATGGTTATGT D27 -12
0.01% TTTCCCC----------------------- | -GATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D24 -23
0.01% TTTCCCCCTC-------------------- | --ATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D22 -20
0.01% TTTCCCCCTCCCCCC--------------- | ---TGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D18 -15
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0.01% TTTCCCCCTCCCCC---------------- | ----GGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D20 -16
0.01% TTTCCCCCTCCCC----------------- | --ATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D19 -17
0.01% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCC-- | ---------------AGGACATGGTTATGT D17 -2
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0.01% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTC--- | -----------------GACATGGTTATGT D20 -3
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0.01% TTTCC------------------------- | GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D25 -25
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0.01% TTTCCCCCTCC------------------- | ----GGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D23 -19
0.01% TTTCCCCCTCC------------------- | --ATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D21 -19
0.01% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT---- | --------------AAGGACATGGTTATGT D18 -4
0.01% TTTCCCCCT--------------------- | --ATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D23 -21
0.01% TTTCCCCCTCCCC----------------- | -------GAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D24 -17
0.01% TTTCCCCCT--------------------- | GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D21 -21
0.01% TTTCCCC----------------------G | GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D22 -23
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0.01% TTTCCC------------------------ | -GATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D25 -24
0.01% TTTCCCCCTCCCCCCC------------GG | GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D12 -14
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0.01% TTTC-------------------------- | GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D26 -26
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0.01% TTTCCCC----------------------- | ------AGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D29 -23
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0.01% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCC-- | ------------------ACATGGTTATGT D20 -2
0.01% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG GCGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT I2+GC
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0.00% TTTCCCC----------------------- | --ATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D25 -23
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0.00% TTTC------------------------GG | GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D24 -26
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0.00% TTTCCC-----------------------G | GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D23 -24
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0.00% TTTCCCCCT-------------------GG | GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D19 -21
0.00% TTTC-------------------------G | GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D25 -26
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0.00% TTTC-------------------------- | -GATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D27 -26
0.00% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTC--- | ----------------------GGTTATGT D25 -3
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0.00% TTT--------------------------G | GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D26 -27
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0.00% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTC--- | ----------------GGACATGGTTATGT D19 -3
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0.00% TTT--------------------------- | -GATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D28 -27
0.00% T---------------------------GG | GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D27 -29
0.00% TTT--------------------------- | GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D27 -27
0.00% T----------------------------- | GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D29 -29
0.00% TTT--------------------------- | --ATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D29 -27
0.00% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT---- | -----------------GACATGGTTATGT D21 -4
0.00% TT---------------------------- | GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D28 -28
0.00% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTC--- | ---------------------TGGTTATGT D24 -3
0.00% TT---------------------------G | GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D27 -28
0.00% T----------------------------G | GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D28 -29
0.00% -----------------------------G | GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D29 -30
0.00% TTT-------------------------GG | GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTTATGT D25 -27
0.00% TTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGTCCGG | G----------------------------T D28 1
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