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DNA break repair outcome predictions

Guide: CCCCCCCTCTGGAGAGTCCG GGG

The following table lists possible deletions and insertions, scored by the Lindel repair model.
Each sequence below represents the context around the guide's target, with deleted nucleotides shown as "-".
Sequences are ranked by their probability, as predicted by the method of Chen et al. 2019.

Probability Sequence Effect
GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT | CCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT wild-type
28.71% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT T CCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT I1+T
9.66% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAG- | --------------CCGAAAGGACATGGTT D15 -1
5.27% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT X CCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT I3+X
3.43% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCC---------- | --GGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D12 -10
3.15% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT | -CGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D1 0
2.71% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAG- | CCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D1 -1
2.16% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGA---- | -------TGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D11 -4
1.68% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGA-- | CCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D2 -2
1.61% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGG----- | ----GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D9 -5
1.59% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAG- | -----GATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D6 -1
1.54% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGA-- | -------TGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D9 -2
1.36% GGGTTTTCCCCCTCCCCC------------ | --GGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D14 -12
1.35% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAG- | ----------AGAGCCGAAAGGACATGGTT D11 -1
1.33% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT | --GGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D2 0
1.23% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT A CCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT I1+A
1.21% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTC-------- | -CGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D9 -8
1.07% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT G CCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT I1+G
1.01% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAG- | ---GGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D4 -1
0.99% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAG- | ----GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D5 -1
0.98% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAG- | ---------GAGAGCCGAAAGGACATGGTT D10 -1
0.98% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAG- | ------------AGCCGAAAGGACATGGTT D13 -1
0.97% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGG----- | -----GATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D10 -5
0.96% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT | ----GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D4 0
0.87% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAG--- | --------------CCGAAAGGACATGGTT D17 -3
0.85% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAG- | ------ATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D7 -1
0.81% GGGTTTTCCCCCTCCCCCC----------- | --GGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D13 -11
0.79% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCC---------- | -CGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D11 -10
0.66% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAG--- | ---GGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D6 -3
0.57% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAG--- | CCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D3 -3
0.55% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT | ----------AGAGCCGAAAGGACATGGTT D10 0
0.48% GGGTTTTCCCCCTCCCC------------- | --GGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D15 -13
0.47% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT | -----GATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D5 0
0.47% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT | ---------GAGAGCCGAAAGGACATGGTT D9 0
0.45% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAG- | -CGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D2 -1
0.43% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT | ------ATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D6 0
0.41% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT | --------GGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D8 0
0.39% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT | ---GGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D3 0
0.38% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCT------- | CCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D7 -7
0.38% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGA---- | CCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D4 -4
0.37% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAG--T | CCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D2 -3
0.35% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT | -------TGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D7 0
0.31% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGA---- | ------ATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D10 -4
0.31% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT | -------------GCCGAAAGGACATGGTT D13 0
0.29% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTC-------- | CCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D8 -8
0.29% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTC-------- | --GGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D10 -8
0.26% GGGTTTTCCCCCTCCC-------------- | --GGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D16 -14
0.25% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT | -----------GAGCCGAAAGGACATGGTT D11 0
0.25% GGGTTTTCCCCCTCC--------------- | --GGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D17 -15
0.24% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT | -----------------AAAGGACATGGTT D17 0
0.24% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGA-T | CCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D1 -2
0.23% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT TTCCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT I2+TT
0.23% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAG--- | --------GGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D11 -3
0.22% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGG----- | ---GGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D8 -5
0.20% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT TACCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT I2+TA
0.20% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAG--- | -----GATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D8 -3
0.20% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAG- | --------GGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D9 -1
0.20% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGG----- | CCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D5 -5
0.19% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAG--- | -CGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D4 -3
0.19% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCC---------- | CCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D10 -10
0.19% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT TGCCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT I2+TG
0.19% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAG- | --GGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D3 -1
0.19% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT TCCCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT I2+TC
0.18% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAG- | -----------------AAAGGACATGGTT D18 -1
0.18% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTG------ | CCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D6 -6
0.17% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT ACCCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT I2+AC
0.17% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT GTCCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT I2+GT
0.16% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT AACCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT I2+AA
0.16% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAG--- | ---------GAGAGCCGAAAGGACATGGTT D12 -3
0.16% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT | C-------GGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D7 1
0.16% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT | C---------------GAAAGGACATGGTT D15 1
0.16% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT ATCCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT I2+AT
0.15% GGGTTTTCCCCC------------------ | --GGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D20 -18
0.15% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCT--------- | --------GGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D17 -9
0.15% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGA---T | CCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D3 -4
0.14% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT | ---------------CGAAAGGACATGGTT D15 0
0.14% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT | --------------------GGACATGGTT D20 0
0.14% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT AGCCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT I2+AG
0.13% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGG----T | CCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D4 -5
0.13% GGGTTTTCCCCCTCCCCC------------ | ---GGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D15 -12
0.12% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCT--------T | CCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D8 -9
0.11% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCT--------- | --GGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D11 -9
0.11% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGA---- | -CGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D5 -4
0.11% GGGTTTTCCC-------------------- | --GGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D22 -20
0.11% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGA-- | ------ATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D8 -2
0.11% GGGTTTTCCCC------------------- | --GGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D21 -19
0.11% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGA-- | -CGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D3 -2
0.10% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAG--- | ----GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D7 -3
0.10% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT | C---------AGAGCCGAAAGGACATGGTT D9 1
0.10% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAG- | ---------------------GACATGGTT D22 -1
0.09% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCT--------- | ---GGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D12 -9
0.09% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGG----- | ---------GAGAGCCGAAAGGACATGGTT D14 -5
0.09% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCT------T | CCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D6 -7
0.09% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCC---------- | ----------------GAAAGGACATGGTT D26 -10
0.09% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTG-----T | CCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D5 -6
0.09% GGGTTTTCCCCCTCCCCCC----------- | ----------------GAAAGGACATGGTT D27 -11
0.09% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCC---------- | ---GGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D13 -10
0.08% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGA-- | ------------------AAGGACATGGTT D20 -2
0.08% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCT------- | --------GGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D15 -7
0.08% GGGTTTTCCCCCTCCCCCC----------- | ---GGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D14 -11
0.08% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT CCCCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT I2+CC
0.08% GGGTTTTCCCCCTCCCCCC----------T | CCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D10 -11
0.08% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGA-- | -------------------------TGGTT D27 -2
0.08% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT C CCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT I1+C
0.08% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGA-- | ----------AGAGCCGAAAGGACATGGTT D12 -2
0.07% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTG------ | ---------GAGAGCCGAAAGGACATGGTT D15 -6
0.07% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTG------ | ----------AGAGCCGAAAGGACATGGTT D16 -6
0.07% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCC---------- | ----GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D14 -10
0.07% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGG----- | -CGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D6 -5
0.06% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT | C--GGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D2 1
0.06% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT | ------------AGCCGAAAGGACATGGTT D12 0
0.06% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCT--------- | ----GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D13 -9
0.06% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTG------ | ----------------------ACATGGTT D28 -6
0.06% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTC-------- | ---------GAGAGCCGAAAGGACATGGTT D17 -8
0.06% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTC-------- | ----GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D12 -8
0.06% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT | ------------------AAGGACATGGTT D18 0
0.06% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTG------ | ------------AGCCGAAAGGACATGGTT D18 -6
0.06% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTG------ | -CGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D7 -6
0.06% GGGTTTTCCCCC------------------ | -CGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D19 -18
0.06% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT | --------------CCGAAAGGACATGGTT D14 0
0.06% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGG----- | --GGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D7 -5
0.06% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAG--- | -------TGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D10 -3
0.06% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT | C------TGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D6 1
0.06% GGGTTTTCCCCCTCCCCC------------ | ----------------GAAAGGACATGGTT D28 -12
0.06% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT | C--------------CGAAAGGACATGGTT D14 1
0.06% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT GACCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT I2+GA
0.05% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT GCCCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT I2+GC
0.05% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT | ----------------------ACATGGTT D22 0
0.05% GGGTTTTCCCCCTCCCC------------- | ----------------GAAAGGACATGGTT D29 -13
0.05% GGGTTTTCC--------------------- | --GGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D23 -21
0.05% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT | ----------------GAAAGGACATGGTT D16 0
0.05% GGGTTTTCCCCCTCCCCC------------ | -----------------AAAGGACATGGTT D29 -12
0.05% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTC-------- | ---------------CGAAAGGACATGGTT D23 -8
0.05% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGG----- | ---------------------GACATGGTT D26 -5
0.05% GGGTTTTCCCC------------------- | ---GGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D22 -19
0.05% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCC---------- | ---------------CGAAAGGACATGGTT D25 -10
0.05% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT | C--------GAGAGCCGAAAGGACATGGTT D8 1
0.04% GGGTTTTCCCCCTCCCC------------- | ---GGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D16 -13
0.04% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAG- | -----------GAGCCGAAAGGACATGGTT D12 -1
0.04% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAG- | ----------------------ACATGGTT D23 -1
0.04% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGA---- | -----------------------CATGGTT D27 -4
0.04% GGGTTTTCCCCCTCCCCC------------ | ----GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D16 -12
0.04% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGA---- | ------------------AAGGACATGGTT D22 -4
0.04% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT | C----------GAGCCGAAAGGACATGGTT D10 1
0.04% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTG------ | ------ATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D12 -6
0.04% GGGTTTTCCCCCTC---------------- | --GGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D18 -16
0.04% GGGTTTTCCCCCTCCCCC-----------T | CCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D11 -12
0.04% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGA---- | ----------AGAGCCGAAAGGACATGGTT D14 -4
0.04% GGGTTTTCCCCCT----------------- | --------GGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D25 -17
0.04% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT | C----GATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D4 1
0.04% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGA-- | ---------------CGAAAGGACATGGTT D17 -2
0.04% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT CACCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT I2+CA
0.03% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGG----- | -----------GAGCCGAAAGGACATGGTT D16 -5
0.03% GGGTTTTCCCCCTCCCC------------T | CCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D12 -13
0.03% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT | C-----ATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D5 1
0.03% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCT------- | -CGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D8 -7
0.03% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGG----- | --------------CCGAAAGGACATGGTT D19 -5
0.03% GGGTTTTC---------------------- | --GGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D24 -22
0.03% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAG--- | --GGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D5 -3
0.03% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGA-- | -----------------------CATGGTT D25 -2
0.03% GGGTTTTCCCCCTC---------------- | ---------GAGAGCCGAAAGGACATGGTT D25 -16
0.03% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT | -----------------------CATGGTT D23 0
0.03% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAG- | --------------------GGACATGGTT D21 -1
0.03% GGGTTTTCCCCCTCCCC------------- | -------------GCCGAAAGGACATGGTT D26 -13
0.03% GGGTTTTCCCCC------------------ | CCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D18 -18
0.03% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT CTCCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT I2+CT
0.03% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT | C---GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D3 1
0.03% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAG--- | ---------------------GACATGGTT D24 -3
0.03% GGGTTTTCC--------------------T | CCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D20 -21
0.03% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCT--------- | -----GATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D14 -9
0.03% GGGTTTTCCCCCTCCC-------------- | ---GGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D17 -14
0.03% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTG------ | -----------------AAAGGACATGGTT D23 -6
0.03% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT CGCCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT I2+CG
0.03% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAG- | ----------------GAAAGGACATGGTT D17 -1
0.03% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCC---------- | -------------------AGGACATGGTT D29 -10
0.03% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT GGCCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT I2+GG
0.02% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGA---- | -------------------AGGACATGGTT D23 -4
0.02% GGGTTTTCCCCCTCC--------------- | ---GGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D18 -15
0.02% GGGTTTTCCCCCTCCCC------------- | -----GATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D18 -13
0.02% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT | -------------------AGGACATGGTT D19 0
0.02% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGA-- | ------------AGCCGAAAGGACATGGTT D14 -2
0.02% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTG------ | --------------CCGAAAGGACATGGTT D20 -6
0.02% GGGTTTTCCCCCTCCCC------------- | ----GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D17 -13
0.02% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT | C-GGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D1 1
0.02% GGGTTTTCCCCCTCCC-------------- | ----GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D18 -14
0.02% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTC-------- | -------TGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D15 -8
0.02% GGGTTTTCCCCCTCCCCCC----------- | --------GGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D19 -11
0.02% GGGTTTTCCCCCTCCCCC------------ | ---------GAGAGCCGAAAGGACATGGTT D21 -12
0.02% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTC-------- | ----------------GAAAGGACATGGTT D24 -8
0.02% GGGTTTTCCCCCTCCCCC------------ | -------TGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D19 -12
0.02% GGGTTTTCCC-------------------- | ----GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D24 -20
0.02% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCT--------- | ----------------GAAAGGACATGGTT D25 -9
0.02% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCC---------- | -----GATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D15 -10
0.02% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCT--------- | -----------------AAAGGACATGGTT D26 -9
0.02% GGGTTTTCCCCCTCCCC------------- | ------------AGCCGAAAGGACATGGTT D25 -13
0.02% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCT--------- | ----------AGAGCCGAAAGGACATGGTT D19 -9
0.02% GGGTTTTCCCCCTCCCCC------------ | ----------AGAGCCGAAAGGACATGGTT D22 -12
0.02% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT | C-----------AGCCGAAAGGACATGGTT D11 1
0.02% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGG---GT | CCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D3 -5
0.02% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGG----- | -------TGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D12 -5
0.02% GGGTTTTCCCCCTCCCCC------------ | -----GATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D17 -12
0.02% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT | ---------------------GACATGGTT D21 0
0.02% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT | C----------------------CATGGTT D22 1
0.02% GGGTTTTCCCCCT----------------- | --GGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D19 -17
0.02% GGGTTTTCCCCCTCCCC-----------GT | CCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D11 -13
0.02% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCC---------- | -----------------AAAGGACATGGTT D27 -10
0.02% GGGTTTTCCCCCTCCCCC------------ | --------GGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D20 -12
0.02% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCC---------- | ------------AGCCGAAAGGACATGGTT D22 -10
0.02% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGG----- | ---------------CGAAAGGACATGGTT D20 -5
0.02% GGGTTTTCCCCCTCCC-------------- | -------TGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D21 -14
0.02% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT | C------------GCCGAAAGGACATGGTT D12 1
0.02% GGGTTTTCCCCCT----------------- | ---GGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D20 -17
0.02% GGGTTTTCCCCCTCCC-------------- | -----GATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D19 -14
0.02% GGGTTTTCCCC------------------- | -------TGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D26 -19
0.02% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT | --------------------------GGTT D26 0
0.02% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTC-------- | -----GATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D13 -8
0.02% GGGTTTTCCCCCTCC--------------T | CCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D14 -15
0.02% GGGTTTTCCCCCT----------------- | ------ATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D23 -17
0.02% GGGTTTTCCCCCTCCCCCC----------- | -------TGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D18 -11
0.02% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT | -----------------------------T D29 0
0.02% GGGTTTTCCCCCTCCCC------------- | -------TGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D20 -13
0.02% GGGTTTTCCCCCTCCCC------------- | --------GGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D21 -13
0.02% GGGTTTTCCCCCTCCCCCC---------GT | CCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D9 -11
0.01% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAG- | -------------GCCGAAAGGACATGGTT D14 -1
0.01% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCT------- | ------ATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D13 -7
0.01% GGGTTTTCCCCCTCCCCCC----------- | ------------------AAGGACATGGTT D29 -11
0.01% GGGTTTTCCCCCTCCCCCC----------- | -----------------AAAGGACATGGTT D28 -11
0.01% GGGTTTTCCCC------------------- | --------GGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D27 -19
0.01% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCC---------- | --------GGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D18 -10
0.01% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT | C------------------AGGACATGGTT D18 1
0.01% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCT------- | ------------------AAGGACATGGTT D25 -7
0.01% GGGTTTTCCCCCT----------------T | CCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D16 -17
0.01% GGGTTTTCCCCCTCC--------------- | ----GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D19 -15
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0.01% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTC-------- | ----------AGAGCCGAAAGGACATGGTT D18 -8
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0.01% GGGTTTTCCCCCTCCCCCC----------- | ----------AGAGCCGAAAGGACATGGTT D21 -11
0.01% GGGTTTTCCC-------------------- | ---GGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D23 -20
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0.01% GGGTTTTCCCCCTCC--------------- | --------GGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D23 -15
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0.01% GGGTTTTCCCCCTCCC-------------- | -----------GAGCCGAAAGGACATGGTT D25 -14
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0.01% GGGTTTTCCCCCTC---------------- | ----GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D20 -16
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0.01% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT | ------------------------ATGGTT D24 0
0.01% GGGTTTTCCCCCT----------------- | -----------GAGCCGAAAGGACATGGTT D28 -17
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0.01% GGGTT------------------------- | CCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D25 -25
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0.01% GGGTTTTCCCCCTCCC-------------- | --------GGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D22 -14
0.01% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCT------- | -------TGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D14 -7
0.01% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT | C--------------------GACATGGTT D20 1
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0.01% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT | C-------------CCGAAAGGACATGGTT D13 1
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0.01% GGGTTTTCCCCCTCC--------------- | ------ATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D21 -15
0.01% GGGTTTT----------------------- | -----GATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D28 -23
0.01% GGGTTTTCCCCC------------------ | ------ATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D24 -18
0.01% GGGTTTTCCCCCTCCCCCC----------- | ------ATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D17 -11
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0.01% GGGTTTTC---------------------- | -----GATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D27 -22
0.01% GGGTTTTCCCCCTCCCC------------- | ------ATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D19 -13
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0.01% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTC-------- | ------ATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D14 -8
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0.01% GGGTTTT----------------------- | ---GGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D26 -23
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0.01% GGGTTTTCCC-------------------- | ------ATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D26 -20
0.01% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTC-------- | -------------GCCGAAAGGACATGGTT D21 -8
0.01% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGG----- | -----------------------CATGGTT D28 -5
0.01% GGGT-------------------------- | CCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D26 -26
0.01% GGGTTT------------------------ | ---GGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D27 -24
0.01% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTC-------- | -----------------AAAGGACATGGTT D25 -8
0.01% GGGTTTTCCCCC------------------ | -----GATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D23 -18
0.01% GGGTTTTCCCC------------------- | ----GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D23 -19
0.01% GGGTT------------------------- | -CGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D26 -25
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0.01% GGGTTTTCC--------------------- | ------ATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D27 -21
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0.01% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGA-- | --------------CCGAAAGGACATGGTT D16 -2
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0.01% GGGTTTT----------------------T | CCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D22 -23
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0.01% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT | C-------------------GGACATGGTT D19 1
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0.00% GGGTTTTCCCCCTCCC------------GT | CCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D12 -14
0.00% GGGTTT------------------------ | -CGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D25 -24
0.00% GGGTTTTCC--------------------- | ----GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D25 -21
0.00% GGGTTTTCCCCCTC---------------- | ----------AGAGCCGAAAGGACATGGTT D26 -16
0.00% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAG- | ---------------------------GTT D28 -1
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0.00% GGGTTTTCCCCCTCC-------------GT | CCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D13 -15
0.00% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCT------- | ------------AGCCGAAAGGACATGGTT D19 -7
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0.00% GGGTTTT----------------------- | --GGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D25 -23
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0.00% GGGTTTT----------------------- | ------ATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D29 -23
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0.00% GGGTTTTCCCCCTCCC-------------- | -------------GCCGAAAGGACATGGTT D27 -14
0.00% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT | C-------------------------GGTT D25 1
0.00% GGGTTTTCCCCCTC---------------- | ------ATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D22 -16
0.00% GGGTTTTCCC------------------GT | CCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D18 -20
0.00% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAG--- | -----------------------CATGGTT D26 -3
0.00% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAG- | -----------------------CATGGTT D24 -1
0.00% GGGTTTTCCCCCT---------------GT | CCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D15 -17
0.00% GGGTTTTCCCCC----------------GT | CCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D16 -18
0.00% GGGTTTT----------------------- | ----GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D27 -23
0.00% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTG------ | -------TGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D13 -6
0.00% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGA---- | ----------------------ACATGGTT D26 -4
0.00% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT | C------------------------TGGTT D24 1
0.00% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT | ----------------------------TT D28 0
0.00% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT | C-----------------AAGGACATGGTT D17 1
0.00% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT | C---------------------ACATGGTT D21 1
0.00% GGGT------------------------GT | CCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D24 -26
0.00% GGGTT------------------------- | ----GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D29 -25
0.00% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT | ---------------------------GTT D27 0
0.00% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCC---------- | ------ATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D16 -10
0.00% GGGTT------------------------- | --GGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D27 -25
0.00% GGGTT------------------------- | ---GGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D28 -25
0.00% GGGTTT------------------------ | ----GGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D28 -24
0.00% GGGTTT------------------------ | -----GATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D29 -24
0.00% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAG--- | ---------------CGAAAGGACATGGTT D18 -3
0.00% GGGTTTTCC-------------------GT | CCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D19 -21
0.00% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTG------ | ------------------AAGGACATGGTT D24 -6
0.00% GGGTTT----------------------GT | CCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D22 -24
0.00% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGG----- | ----------------GAAAGGACATGGTT D21 -5
0.00% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAG- | ------------------AAGGACATGGTT D19 -1
0.00% GGGT-------------------------- | -CGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D27 -26
0.00% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCT------- | -------------------AGGACATGGTT D26 -7
0.00% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGA---- | --------------CCGAAAGGACATGGTT D18 -4
0.00% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGG----- | --------------------GGACATGGTT D25 -5
0.00% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCT------- | ----------------------ACATGGTT D29 -7
0.00% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCT------- | --------------CCGAAAGGACATGGTT D21 -7
0.00% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTG------ | ---------------CGAAAGGACATGGTT D21 -6
0.00% GGGTTTT---------------------GT | CCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D21 -23
0.00% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTG------ | -----------------------CATGGTT D29 -6
0.00% GGGT-------------------------- | ---GGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D29 -26
0.00% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTG------ | -------------------AGGACATGGTT D25 -6
0.00% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGA-- | ----------------------ACATGGTT D24 -2
0.00% GG---------------------------- | -CGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D29 -28
0.00% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGA-- | -----------------AAAGGACATGGTT D19 -2
0.00% GG---------------------------T | CCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D27 -28
0.00% GGGTT-----------------------GT | CCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D23 -25
0.00% GGG--------------------------- | -CGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D28 -27
0.00% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCT------- | ---------------CGAAAGGACATGGTT D22 -7
0.00% GGG--------------------------- | CCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D27 -27
0.00% G----------------------------- | CCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D29 -29
0.00% GGG--------------------------- | --GGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D29 -27
0.00% GG---------------------------- | CCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D28 -28
0.00% G----------------------------T | CCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D28 -29
0.00% -----------------------------T | CCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D29 -30
0.00% GGG-------------------------GT | CCGGGGATGGAGAGCCGAAAGGACATGGTT D25 -27
0.00% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGAGAGT | C----------------------------T D28 1
0.00% GGGTTTTCCCCCTCCCCCCCTCTGGA---- | -----------------AAAGGACATGGTT D21 -4
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